La Fundación está regida, como es preceptivo, por un Patronato, al que corresponde el gobierno y la representación de la Fundación.
Está constituido por la Dirección General de la Institución, los cuatro directores de los Colegios Los Sauces y dos padres de alumnos.
Presidenta: Pilar Sainz (Directora General Institución Educativa Los Sauces)
Patrono: Carmen García (Directora Colegio Los Sauces La Moraleja)
Patrono: Elena Franganillo (Directora Colegio Los Sauces Torrelodones)
Patrono: Manuel Casal (Director Colegio Los Sauces Pontevedra)
Patrono: Alberto Alvarez (Director Colegio Los Sauces Vigo)
Patrono: Carlos Jiménez (Padre de un alumno de Los Sauces)
Secretario: José Antonio Rois (Subdirector General Institución Educativa Los Sauces)